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短串联重复序列(short tandem repeats,STR)鉴定
简介

微卫星DNA(Microsatellite DNA),又称为短小串联重复(Short tandem repeats,STR)或简单重复序列(Simple repeat sequence, SRS或SSR),广泛存在于原核生物和真核生物基因组中,常见的有二、三、四核苷酸重复序列,约占真核生物基因组的5%,其基本构成单元(核心序列)为1–6bp。其中最为常见的是双核苷酸重复即(CA)n和(TG)n,人类基因组约有5×104~1×105个(CA)n重复序列,占基因组的10%。每个微卫星DNA的核心序列结构相同,重复单位数目约为10~60次,其长度一般不超过300bp,多位于基因非编码区、内含子或非翻译区,可存在于Alu序列中或卫星序列中,但在编码序列及外显子中也可找到微卫星DNA的存在。微卫星DNA的高度多态性主要来源于串联数目的不同。由于重复单位及重复次数不同,使微卫星DNA在不同种族,不同人群之间的分布具有很大差异性,构成了STR遗传多态性。并且不同个体之间在一个同源STR位点的重复次数也不同,因此类似于指纹识别,STR位点分析也可对个人进行身份识别。通过识别基因组在特定位点的特定序列重复,可能创建一个个人基因档案。目前已经有超过10000个STR位点被公开。STR分析法已经成为法医学领域个体识别和亲权鉴定的重要分析方法,可应用于司法案件调查,也就是遗传指纹分析。

PCR法鉴定STR

PCR法鉴定STR


STR的成因

有丝分裂过程中DNA链之间的错配引起的复制滑动被认为是导致STR产生的最常见原因,一般来说平均每经历一千世代会有千分之一的微卫星DNA会发生复制滑动。研究发现重复序列间的复制滑动要比基因组其它部位发生的点突变的概率高出多个数量级。大多的复制滑动仅会导致一个重复单元的改变,并且依据不同复制单元大小的不同,以及不同物种之间,复制滑动发生的概率也不相同。



STR的检测方法

STR的检测方法是针对基因组特定的多态性区域设置引物进行PCR扩增,然后对扩增产物通过凝胶电泳或毛细管电泳进行鉴别,该方法可以确定某个位点具体有多少个重复的微卫星序列,并可绘制STR图谱。通常情况下,每一个STR位点会被约5-20%的人们所共有,而STR分析的优势就体现在可以同时鉴别多个STR位点。通过最终生成的STR图谱可以非常精确地鉴别每个个体。理论上联合应用16个STR位点,其个体识别率可达0.999999999998。


典型的STR图谱

典型的STR图谱

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共 17 个关于【短串联重复序列(short tandem repeats,STR)鉴定】的回复 最后回复于 2016-4-7 10:40

天边闲云 发表于 2014-1-11 21:01:36 | 显示全部楼层
总结的很好,学习了
迷糊俏喵喵 发表于 2014-1-13 19:53:54 | 显示全部楼层
向楼主的分享精神致敬
夏夜星空 发表于 2014-1-22 23:09:20 | 显示全部楼层
前来围观
舟自横 发表于 2014-2-3 21:00:05 | 显示全部楼层
非常不错,感谢分享!
夕阳居士 发表于 2014-2-5 15:23:34 | 显示全部楼层
非常不错,感谢分享!
蓝臭臭 发表于 2014-2-8 00:16:34 | 显示全部楼层
很不错的哦,支持,加油
钱途无限 发表于 2014-2-16 14:38:33 | 显示全部楼层
谢谢楼主,收藏
面包糖 发表于 2014-2-24 13:37:32 | 显示全部楼层
学习一下!十分感谢
踏雪 发表于 2014-3-1 13:04:16 | 显示全部楼层
虚心向楼主学习
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